As bactérias do género Mycobacterium são bacilos (pleomórficos) gram positivo retos ou encurvados, cocobacilos, filamentosos ou formas ramificadas. Este organismo tem um comprimento de aproximadamente 1 a 10 μm, uma largura entre 0.2 e 0.6 μm e não formam esporo, flagelo ou cápsula. Apresenta uma parede complexa quanto à sua composição química, Lipídios de natureza hidrofóbica para a parede e ainda Bacilos Álcool Ácidos Resistentes (BAAR). Estas bactérias são intracelulares que infetam e proliferam-se no interior de macrófagos e linfócitos.
Sintomas
Os sintomas da tuberculose estão principalmente relacionados com o desenvolvimento da bactéria nos pulmões. Causando:
No entanto, quando a bactéria se desenvolve em outros órgãos, é possível que surjam outros sintomas tais como:
Tuberculose
A Tuberculose é a responsável pela morte de mais de 1 bilião de pessoas nos últimos 200 anos, esta doença cronica infeciosa é provocada pela bactéria Mycobacterium tuberculosis. Esta bactéria propaga-se pelo ar, quando uma pessoa infetada tosse, espirra, fala ou expele saliva podendo ser inalada por outro individuo. O sucesso da infeção e do desenvolvimento de tuberculose depende da sucessão de 4 passos: a fagocitose do bacilo, a multiplicação multicelular, o período de latência da infeção e da infeção ativa do pulmão.
Atualmente a Tuberculose continua a ser responsável pelo maior número de mortes provocadas por um único agente infecioso, causando cerca de 10,4 milhões de novos casos e 1,7 milhão de mortes por ano.
Ciclo de vida da bactéria
A resposta imunológica para a Mycobacterium tuberculosis não é completamente eficaz. Esta leva a bactéria para um estado latente, mas raramente a elimina. Infelizmente o estado latente da Mycobacterium tuberculosis é reversível, e a reativação da tuberculose é a fonte da maioria das transmissões (7). A infeção da tuberculose acontece em 4 etapas: A resposta inicial dos macrófagos, a etapa de crescimento, a etapa de controlo imunológico e a etapa do abcesso pulmonar. Estas quatro etapas ocorrem em cerca de 1 mês.
Proteína: UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase
Gene: murA
Organismo: Mycobacterium tuberculosis
Localização subcelular: Citoplasma e Citosol
Definição: Mycobacterium tuberculosis murA confere resistência intrínseca à fosfomicina. Acredita-se que a presença de um resíduo de ácido aspártico no lugar da cisteína crítica na posição 117 que permite a ligação da fosfomicina seja responsável por esta resistência intrínseca.
Mecanismo de resistência: Alteração do alvo do antibiótico
Função Biológica: Formação da parede celular. Adiciona enolpiruvil a UDP-N-acetilglucosamina.
SequênciaTMHMM Result
0 domínios transmembranares
Cell-PLoc 2.0
Encontra-se localizado no Citoplasma
NetPhos - 3.1 Result
aproximadamente 25 locais genéricos de fosforilação
Recorrendo à ferramenta blastp, obtemos o ficheiro fasta na base de dados Non-redundant protein sequences(nr) ficando com um ficheiro fasta com os alinhamentos com maior score. Estes ficheiro resultante do alinhamento foi utilizado no ClustalW para fazer o alinhamento multiplo de sequencias. Que de seguida foi iterado através do package Bio.Phylo do Biopython de modo analisarmos a filogenia do gene.
Observando a seguinte arvóre filogenética verifica-se que a espécie de interesse é aquela que se diverge mais do ancestral comum, ou seja, WP_122443940.1
Proteína: Phenolphthiocerol/phthiocerol polyketide synthase subunit D
Gene: ppsD
Organismo: Mycobacterium tuberculosis
Definição: Mutações em ppsD podem contribuir ou conferir resistência à pirazinamida (antibiótico).
Mecanismo de resistência: Alteração do alvo do antibiótico
SequênciaParte do complexo ppsABCDE envolvido na biossíntese do núcleo lipídico comum a fthiocerols e fenolphthiocerols por sucessivas adições de unidades extensoras de malonílico-CoA ou metilmalonil-CoA.
PpsD adiciona uma unidade (R)-metilmalonil e PpsE adiciona uma segunda (R)-unidade de metilmalonil. A incorporação das unidades de metilmalonilo resulta na formação de dois grupos de metila ramificados no produto alongado.
TMHMM Result
0 domínios transmembranares
Cell-PLoc 2.0
Encontra-se localizado no Citoplasma
NetPhos - 3.1 Result
aproximadamente 125 locais genéricos de fosforilação
Recorrendo à ferramenta blastp, obtemos o ficheiro fasta na base de dados Non-redundant protein sequences(nr) ficando com um ficheiro fasta com os alinhamentos com maior score. Estes ficheiro resultante do alinhamento foi utilizado no ClustalW para fazer o alinhamento multiplo de sequencias. Que de seguida foi iterado através do package Bio.Phylo do Biopython de modo analisarmos a filogenia do gene.
Observando a seguinte arvóre filogenética verifica-se que a espécie de interesse é aquela que se diverge mais do ancestral comum, ou seja, WP_031696609.1
Staphylococcus aureus (S. aureus) é uma bactéria esférica gram-positiva, da família Micrococcaceae, responsável por várias infeções locais e sistémicas em seres humanos. Estas bactérias possuem aproximadamente um diâmetro de 0,5 a 1,5 µm e são caracterizadas pela forma de cocos, falta de mobilidade e por serem não-esporuladas.
Os seres humanos são um reservatório natural de S. aureus e estima-se que cerca de 30% a 50% da população adulta saudável se encontre infetada, dos quais 10% a 20% são infetados de forma persistente.
O uso contínuo de antibióticos contra esta bactéria resulta no desenvolvimento de estirpes resistentes. Atualmente, a mupirocina é o antibiótico usado contra a S. aureus e MDR (resistente à meticilina).
As infeções por Staphylococcus aureus oscilam de leves a potencialmente mortais. Esta bactéria provoca infeções que afetam a pele e podem ser:
Proteína: Isoleucine-tRNA ligase
Gene: ileS
Organismo: Staphylococcus aureus
Definição: Identifica mutações para a isoleucil-tRNA sintetase em Staphylococcus aureus que conferem resistência à mupirocina.
Função biológica: Catalisa a ligação da isoleucina ao tRNA.
Mecanismo de resistência: Alteração do alvo do antibiótico
Função Biológica: Catalisa a ligação da isoleucina ao tRNA.
SequênciaTMHMM Result
0 domínios transmembranares
Cell-PLoc 2.0
Encontra-se localizado no Citoplasma
NetPhos - 3.1 Result
Aproximadamente 85 locais genéricos de fosforilação
Recorrendo à ferramenta blastp, obtemos o ficheiro fasta na base de dados Non-redundant protein sequences(nr) ficando com um ficheiro fasta com os alinhamentos com maior score. Estes ficheiro resultante do alinhamento foi utilizado no ClustalW para fazer o alinhamento multiplo de sequencias. Que de seguida foi iterado através do package Bio.Phylo do Biopython de modo analisarmos a filogenia do gene.
Observando a seguinte arvóre filogenética verifica-se que a espécie de interesse é aquela que se diverge mais do ancestral comum, ou seja, WP_117206703.1
Proteína: Phosphatidylglycerol lysyltransferase
Gene: mprF
Organismo: Staphylococcus aureus
Definição: MprF é um gene que modifica o fosfatidilglicerol carregado negativamente na superfície da membrana.
Mecanismo de resistência: Alteração do alvo do antibiótico
SequênciaEste gene é responsável pela transferência de um grupo lisil de L-lisil-tRNA para o fosfatidilglicerol ligado à membrana, produzindo lisilfosfatidilglicerol, um componente fundamental da membrana bacteriana com uma carga líquida positiva. A síntese deste componente contribui para a virulência da bactéria por estar envolvida no mecanismo de resistência aos peptídeos antimicrobianos catiónicos produzidos pelo sistema imunológico do hospedeiro e pelos microrganismos concorrentes.
TMHMM Result
14 domínios transmembranares
Cell-PLoc 2.0 Result
Encontra-se localizado na Membrana Celular
NetPhos - 3.1 Result
Aproximadamente 51 locais genéricos de fosforilação
Recorrendo à ferramenta blastp, obtemos o ficheiro fasta na base de dados Non-redundant protein sequences(nr) ficando com um ficheiro fasta com os alinhamentos com maior score. Estes ficheiro resultante do alinhamento foi utilizado no ClustalW para fazer o alinhamento multiplo de sequencias. Que de seguida foi iterado através do package Bio.Phylo do Biopython de modo analisarmos a filogenia do gene.
Observando a seguinte arvóre filogenética verifica-se que a espécie de interesse é aquela que se diverge mais do ancestral comum, ou seja, WP_16033544.1